Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacna1cQ01815 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna1cQ01815 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms