Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja5Q01231 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja5Q01231 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms