Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cry1P97784 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cry1P97784 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cry1P97784 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms