Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bop1P97452 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bop1P97452 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bop1P97452 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms