Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll3P85442 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll3P85442 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms