Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SgcdP82347 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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SgcdP82347 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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