Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx1P81068 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx1P81068 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms