Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ufd1P70362 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufd1P70362 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufd1P70362 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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