Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp7P70280 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms