Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou3f4P62515 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou3f4P62515 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms