Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Copz1P61924 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms