Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Arpc4P59999 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arpc4P59999 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms