Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sf3b6P59708 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3b6P59708 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms