Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Faf1P54731 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Faf1P54731 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms