Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad23bP54728 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Rad23bP54728 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23bP54728 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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