Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RorcP51450 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RorcP51450 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RorcP51450 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RorcP51450 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms