Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FanccP50652 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FanccP50652 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FanccP50652 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FanccP50652 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FanccP50652 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FanccP50652 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FanccP50652 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FanccP50652 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FanccP50652 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FanccP50652 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FanccP50652 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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FanccP50652 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FanccP50652 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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FanccP50652 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FanccP50652 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FanccP50652 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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FanccP50652 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FanccP50652 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FanccP50652 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FanccP50652 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FanccP50652 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FanccP50652 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FanccP50652 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms