Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax7P47239 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms