Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tac1P41539 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tac1P41539 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tac1P41539 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms