Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 2810403D21Rik-209ENSMUST00000207966 1433 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd11P23813 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd11P23813 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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