Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ggta1P23336 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ggta1P23336 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms