Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cox5bP19536 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms