Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms