Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rps6ka1P18653 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms