Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18532 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18532 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18532 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18532 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18532 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18532 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms