Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18528 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18528 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18528 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
P18528 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
P18528 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms