Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18526 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18526 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18526 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P18526 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18526 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18526 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18526 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18526 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18526 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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P18526 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18526 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18526 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18526 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18526 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18526 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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