Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms