Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh3P10287 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms