Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hoxb5P09079 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxb5P09079 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxb5P09079 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Hoxb5P09079 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb5P09079 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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