Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc8P09025 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc8P09025 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms