Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb6P09023 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb6P09023 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms