Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TtrP07309 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtrP07309 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtrP07309 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtrP07309 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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TtrP07309 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtrP07309 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtrP07309 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtrP07309 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
TtrP07309 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtrP07309 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtrP07309 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtrP07309 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtrP07309 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtrP07309 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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