Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CrygdP04342 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CrygdP04342 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms