Protein–RNA interactions for Protein: P03872

REP2, Partitioning protein REP2, yeastyeast

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REP2P03872 YMR321CYMR321C 318 nt0.26□□□□□ -2.37
REP2P03872 YPL068CYPL068C 882 nt0.26□□□□□ -2.37
REP2P03872 YOR053WYOR053W 342 nt0.25□□□□□ -2.37
REP2P03872 SGF11YPL047W 300 nt0.25□□□□□ -2.37
REP2P03872 VIK1YPL253C 1944 nt0.25□□□□□ -2.37
REP2P03872 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.24□□□□□ -2.37
REP2P03872 ASE1YOR058C 2658 nt0.24□□□□□ -2.37
REP2P03872 SEC8YPR055W 3198 nt0.23□□□□□ -2.37
REP2P03872 YLR434CYLR434C 384 nt0.23□□□□□ -2.37
REP2P03872 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.23□□□□□ -2.37
REP2P03872 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.22□□□□□ -2.37
REP2P03872 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.21□□□□□ -2.38
REP2P03872 PRP5YBR237W 2550 nt0.21□□□□□ -2.38
REP2P03872 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.21□□□□□ -2.38
REP2P03872 YLR334CYLR334C 381 nt0.21□□□□□ -2.38
REP2P03872 OST4YDL232W 111 nt0.2□□□□□ -2.38
REP2P03872 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.2□□□□□ -2.38
REP2P03872 YPL225WYPL225W 441 nt0.2□□□□□ -2.38
REP2P03872 TAR1YLR154W-C 375 nt0.19□□□□□ -2.38
REP2P03872 RPS25BYLR333C 327 nt0.19□□□□□ -2.38
REP2P03872 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.19□□□□□ -2.38
REP2P03872 VPS20YMR077C 666 nt0.19□□□□□ -2.38
REP2P03872 PRP42YDR235W 1635 nt0.19□□□□□ -2.38
REP2P03872 ESP1YGR098C 4893 nt0.18□□□□□ -2.38
REP2P03872 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.17□□□□□ -2.38
REP2P03872 CSN9YDR179C 489 nt0.17□□□□□ -2.38
REP2P03872 YJL007CYJL007C 315 nt0.17□□□□□ -2.38
REP2P03872 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.17□□□□□ -2.38
REP2P03872 YAR029WYAR029W 225 nt0.17□□□□□ -2.38
REP2P03872 HAL9YOL089C 3093 nt0.17□□□□□ -2.38
REP2P03872 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.16□□□□□ -2.38
REP2P03872 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.16□□□□□ -2.38
REP2P03872 snR190snR190 190 nt0.16□□□□□ -2.38
REP2P03872 YHR138CYHR138C 345 nt0.15□□□□□ -2.39
REP2P03872 YKL063CYKL063C 504 nt0.15□□□□□ -2.39
REP2P03872 YJL120WYJL120W 324 nt0.14□□□□□ -2.39
REP2P03872 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.14□□□□□ -2.39
REP2P03872 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.13□□□□□ -2.39
REP2P03872 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.13□□□□□ -2.39
REP2P03872 YOR345CYOR345C 351 nt0.13□□□□□ -2.39
REP2P03872 YPL205CYPL205C 345 nt0.13□□□□□ -2.39
REP2P03872 ORC3YLL004W 1851 nt0.12□□□□□ -2.39
REP2P03872 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.12□□□□□ -2.39
REP2P03872 YLR202CYLR202C 327 nt0.12□□□□□ -2.39
REP2P03872 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.12□□□□□ -2.39
REP2P03872 LEE1YPL054W 906 nt0.12□□□□□ -2.39
REP2P03872 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.11□□□□□ -2.39
REP2P03872 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.1□□□□□ -2.39
REP2P03872 YBR285WYBR285W 435 nt0.1□□□□□ -2.39
REP2P03872 NNF2YGR089W 2811 nt0.1□□□□□ -2.39
REP2P03872 RPS26AYGL189C 360 nt0.09□□□□□ -2.4
REP2P03872 HTB2YBL002W 396 nt0.07□□□□□ -2.4
REP2P03872 SSS1YDR086C 243 nt0.06□□□□□ -2.4
REP2P03872 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.06□□□□□ -2.4
REP2P03872 YKL136WYKL136W 399 nt0.06□□□□□ -2.4
REP2P03872 COX12YLR038C 252 nt0.06□□□□□ -2.4
REP2P03872 PRM3YPL192C 402 nt0.06□□□□□ -2.4
REP2P03872 RPL35AYDL191W 363 nt0.05□□□□□ -2.4
REP2P03872 YER079WYER079W 633 nt0.05□□□□□ -2.4
REP2P03872 YAR053WYAR053W 297 nt0.05□□□□□ -2.4
REP2P03872 YNL146WYNL146W 303 nt0.05□□□□□ -2.4
REP2P03872 YOR121CYOR121C 306 nt0.05□□□□□ -2.4
REP2P03872 YPR092WYPR092W 306 nt0.05□□□□□ -2.4
REP2P03872 BUL2YML111W 2763 nt0.05□□□□□ -2.4
REP2P03872 RCO1YMR075W 2055 nt0.04□□□□□ -2.4
REP2P03872 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.04□□□□□ -2.4
REP2P03872 AGA2YGL032C 264 nt0.03□□□□□ -2.4
REP2P03872 YLR282CYLR282C 342 nt0.03□□□□□ -2.4
REP2P03872 ULI1YFR026C 510 nt0.02□□□□□ -2.41
REP2P03872 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.02□□□□□ -2.41
REP2P03872 YJR157WYJR157W 363 nt0.02□□□□□ -2.41
REP2P03872 COY1YKL179C 2040 nt0.02□□□□□ -2.41
REP2P03872 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.01□□□□□ -2.41
REP2P03872 YNL324WYNL324W 396 nt0.01□□□□□ -2.41
REP2P03872 COG8YML071C 1824 nt0.01□□□□□ -2.41
REP2P03872 NIP1YMR309C 2439 nt0.01□□□□□ -2.41
REP2P03872 YDR048CYDR048C 315 nt0□□□□□ -2.41
REP2P03872 YCR022CYCR022C 345 nt-0.01□□□□□ -2.41
REP2P03872 RPS27BYHR021C 249 nt-0.01□□□□□ -2.41
REP2P03872 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.01□□□□□ -2.41
REP2P03872 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.02□□□□□ -2.41
REP2P03872 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.02□□□□□ -2.41
REP2P03872 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.02□□□□□ -2.41
REP2P03872 Q0017Q0017 162 nt-0.02□□□□□ -2.41
REP2P03872 CSE2YNR010W 450 nt-0.03□□□□□ -2.41
REP2P03872 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.03□□□□□ -2.41
REP2P03872 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.03□□□□□ -2.41
REP2P03872 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.04□□□□□ -2.42
REP2P03872 snR45snR45 172 nt-0.05□□□□□ -2.42
REP2P03872 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.06□□□□□ -2.42
REP2P03872 YKU70YMR284W 1809 nt-0.06□□□□□ -2.42
REP2P03872 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.07□□□□□ -2.42
REP2P03872 BLI1YKL061W 342 nt-0.07□□□□□ -2.42
REP2P03872 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.08□□□□□ -2.42
REP2P03872 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-0.09□□□□□ -2.42
REP2P03872 YEL073CYEL073C 324 nt-0.1□□□□□ -2.43
REP2P03872 snR60snR60 104 nt-0.11□□□□□ -2.43
REP2P03872 SNU13YEL026W 381 nt-0.11□□□□□ -2.43
REP2P03872 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.11□□□□□ -2.43
REP2P03872 YLR232WYLR232W 348 nt-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms