Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccl20O89093 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl20O89093 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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