Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp9O88851 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp9O88851 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms