Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nid2O88322 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nid2O88322 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms