Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LatO54957 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LatO54957 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LatO54957 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LatO54957 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LatO54957 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LatO54957 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms