Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EdaO54693 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EdaO54693 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EdaO54693 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EdaO54693 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EdaO54693 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EdaO54693 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EdaO54693 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EdaO54693 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EdaO54693 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EdaO54693 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EdaO54693 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms