Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sp100O35892 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Sp100O35892 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Sp100O35892 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sp100O35892 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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