Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KeraO35367 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KeraO35367 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KeraO35367 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KeraO35367 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KeraO35367 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KeraO35367 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KeraO35367 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms