Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc23O35125 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms