Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efna5O08543 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efna5O08543 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms