Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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