Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lipo1J3QME6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms