Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim15G3UY57 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms