Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm44G3UW88 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm44G3UW88 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms