Protein–RNA interactions for Protein: F7BY56

Gm8138, Predicted gene 8138 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8138F7BY56 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8138F7BY56 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8138F7BY56 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms