Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
5031410I06RikE9Q4E0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
5031410I06RikE9Q4E0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms